DBCLS
しばらく前にDBCLSでやっている仕事についてのブログをWordPressで立ち上げました．興味がある方はぜひご覧ください． g86 has gone.
バイト日記． リファクタリング続き がんばる． なるべくメソッドを分割してunit testしやすいように．
バイト日記化しつつある． Cufflinksの実行方法について再検討 遺伝子発現を見るためのツール「Cufflinks」 http://cufflinks.cbcb.umd.edu/index.html 対処法を相談した結果 → http://d.hatena.ne.jp/yag_ays/20100611/1276224172 今まで書いたコードのリフ…
バイトでやったことのメモ． SGE用ジョブ投入スクリプトのBowtieへの対応 マッピングツールBowtieをクラスタ環境で分散処理できるようにする http://bowtie-bio.sourceforge.net/index.shtml 自作のSGE用ジョブ投入スクリプトgmapを改変して対応する gmapは…
バイトでやったことのメモメモ． SOAPalsを使いたい An ab initio detector of alternative splicing events with RNA-Seq. http://soap.genomics.org.cn/soapals.html ドキュメントに書いてある情報が足りなくて使い方が分からない 「"<insert length>" is the length of t</insert>…
バイトでやったことのメモ． SOAPalsを使う An ab initio detector of alternative splicing events with RNA-Seq. http://soap.genomics.org.cn/soapals.html reference genomeのindexファイルを作る必要あり indexファイルがSOAPalignerのやつと互換性がな…
