バイトでやったことのメモ．
SOAPalsを使う
- An ab initio detector of alternative splicing events with RNA-Seq.
- http://soap.genomics.org.cn/soapals.html
- reference genomeのindexファイルを作る必要あり
- indexファイルがSOAPalignerのやつと互換性がないみたい…
- TopHatと比較(計算時間，精度)とかやりたい
次やることの関連論文
- ↑の計算が思いの外時間がかかるのでその間に論文を読む
- 遺伝：スプライシングコードを解読する : Nature
