今日のDBCLS

バイトでやったことのメモ.

SGE用ジョブ投入スクリプトのBowtieへの対応

  • マッピングツールBowtieをクラスタ環境で分散処理できるようにする
  • http://bowtie-bio.sourceforge.net/index.shtml
  • 自作のSGE用ジョブ投入スクリプトgmapを改変して対応する
    • gmapは現在TopHat (with Cufflinks),SOAP2に対応済み
  • 対応完了

Twitter bot「body3d」のOAuth対応